FFPE (фиксированные в формалине парафинизированные образцы)

Выделение нуклеиновых кислот из образцов FFPE (фиксированные в формалине парафинизированные образцы) обычно является сложной задачей. Причиной проблем являются:
- качество используемых для фиксации материалов (формалин и парафин)
- повреждение нуклеиновой кислоты в процессе фиксации формалином
- "сшивание" нуклеиновой кислоты с белками в клетках образца
- сложность отделения "пришитой" нуклеиновой кислоты от белков
- высокий риск потери сильно деградированной нуклеиновой кислоты в процессе выделения и отмывки на частицах

В предлагаемом нами наборе мы оптимизировали выделение и очистку даже сильно деградированных нуклеиновых кислот из фиксированных в формалине парафинизированных образцов. 

Входящие в набор буфера с высокой эффективностью выделяют о очищают нуклеиновую кислоту (ДНК и РНК), химически модифицированную формалином во время фиксации.

Единственное возможное осложнение, когда фиксация была сделана некорректно и привела к безвозвратному повреждению нуклеиновой кислоты. В зависимости от качества процедуры фиксации примерная длина изолированной нуклеиновой кислоты может варьироваться от 100 до 800 п.н. Это необходимо учитывать при разработке праймеров или других тест-систем. Большое значение для качественного выделения также имеет время и условия хранения парафиновых блоков с образцами.